腸胃肝膽內科主任 陳炳憲醫師
腸道被譽為「人體第二個大腦」，其健康狀態日益受到重視。傳統對腸胃道疾病的觀念，多停留於胃腸鏡檢查、治療潰瘍、切除息肉等。但多數就診的患者，主要不適為反覆腹痛、腹脹、腹瀉、便祕或消化不良等症狀，即使接受內視鏡或超音波檢查，卻找不出明確病灶，這些臨床表現通稱為功能性腸道疾病，這些症狀看似輕微，但長期影響生活品質。
目前大多醫師治療仍多仰賴經驗，如給予制酸劑、腸胃蠕動藥物或益生菌等，然而，面對「功能性腸胃問題」如盲人摸象。甚至過度使用藥物也帶來可能的副作用。隨著科技進步及精準醫療時代，現在能以更精準、科學的方式，深入剖析腸道的奧秘，而『腸道微菌叢』，正是這股浪潮的引領者。
▌腸道微菌叢：健康的關鍵指揮官
腸道內居住著數以兆計的微生物，組成了複雜而龐大的生態系統，稱為「腸道微菌叢」，其中包含細菌、病毒、真菌等多種微生物，其種類與數量遠超過人體細胞。它們不僅協助消化食物，還參與免疫系統調控、維生素合成，甚至影響情緒與行為。近年研究發現，當腸道微菌叢失衡，也就是「生態失調（Dysbiosis）」，與許多疾病發生和進展有密切關聯，這並非單一菌種的作祟，而是整個微生態系統的穩定性出了問題。
1.功能性腸道疾病（FGIDs）：是常見的慢性消化道疾病，如大腸激躁症。症狀上為反覆發生，如腹痛、腹脹、便秘或腹瀉。過去，病症被認為與壓力、飲食或腸道蠕動異常有關，如今有許多證據證明，腸道微菌叢失衡在其中扮演關鍵角色。如患者腸內雙歧桿菌的豐度降低，或某些引起發炎的菌種增加。
2.其他消化道疾病：腸道微菌叢失衡（多樣性下降、致病菌如大腸桿菌、梭狀芽孢桿菌等的過度生長）也與發炎性腸道疾病、大腸癌等器質性疾病直接相關。
3.代謝性、免疫與神經疾病：腸道菌群能影響身體對食物的代謝，進而關聯到肥胖、糖尿病等代謝性疾病，也與類風濕性關節炎等自體免疫疾病相關。此外，腸道與大腦之間存在著「腸-腦軸線（Gut-Brain Axis）」的雙向溝通，腸道菌群的失衡也被認為與憂鬱症、焦慮症，甚至帕金森氏症等神經精神疾病有關。
▌糞便微菌叢NGS檢測：打開腸道世界的金鑰匙
隨著次世代基因定序（Next-Generation Sequencing, NGS）技術發展，我們得以更精準解讀腸道微菌叢的密碼。透過分析糞便樣本中的微生物DNA，利用NGS技術對其進行全面且高通量的定序。相較於傳統微生物培養，或聚合酶酵素連鎖反應，NGS具備更高解析度、全面性及精準度，為腸道健康評估開啟全新視野。
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傳統檢測方式 |
次世代微菌叢定序（NGS） |
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精細度 |
一次只能檢測幾種菌 |
一次檢測百餘種細菌 |
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靈敏度 |
依靠肉眼培養，精準度較低 |
精準比對資料庫序列，靈敏度高 |
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整體概況 |
無法確認菌叢比例 |
可分析菌叢組成，判定是否有失衡狀況 |
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個人化健康管理 |
難以做個人化建議 |
可作為個人化健康管理指標，包含飲食及生活調整、疾病預防策略 |
▌次世代微菌叢定序，如何檢測？檢測後可以得到哪些資訊？
只需採集「糞便檢體」，為非侵入式採檢。檢測完成後，醫師能快速掌握您的菌相特徵，如有多少好菌、壞菌、腸道菌種多樣性及是否出現特定致病菌，並根據結果給予個人化保健建議（如益生菌與益生元的選擇、飲食與生活建議等）。同時透過菌相與相關疾病的比對提供疾病風險分析及預防策略。
醫學與科學不斷進度，作為提供健康照護的守護者，正從「處理症狀」轉向「個人專屬」的精準醫療。醫師不再僅是提供廣泛適用的藥物治療，而是依據科學檢測給予治療及預防疾病。糞便微菌叢NGS檢測與糞便微菌叢移植是這波精準醫療浪潮的開端。我們期許未來能有更多工具加入，革新對腸道健康認知，守護真正的腸胃健康。
